يقصد المسلمون الجوامع للاعتكاف في شهر رمضان المبارك وخصوصا في العشر الأواخر منه، وذلك للانقطاع عن شواغل الدنيا والتفرغ للعبادة.
لذلك حرصت إدارة الجامع على تهيئة قبو الجامع في العشر الأخيرة من شهر رمضان المبارك، وتخصيصه للمعتكفين، ووضعت آلية لتنظيم برنامج الاعتكاف، بدءًا من تسجيل بيانات المعتكف، وإبلاغه بتعليمات الإدارة، ومن ثم منحه بطاقة المعتكف.
كما يتم تجهيز المعتَكَف وتوفير كافة المستلزمات للمعتكفين، ومن ذلك تأمين وجبتي الإفطار والسحور للمعتكفين، وتخصيص ركن (بوفيه مفتوح) لهم، كما يتم تكليف مشرفين وحراس أمن لضمان تنفيذ البرنامج على الوجه المطلوب وضمان راحة المعتكفين، وسلامتهم.
ويبلغ عدد المعتكفين أكثر من مائتي شخص سنويا.